RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	OR3A2	P47893	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PDX1	P52945	283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	NTHL1	P78549	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PAX2	Q02962	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR7A5	Q15622	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	VAMP3	Q15836	100 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	DECR1	Q16698	335 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	XKR7	Q5GH72	579 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	STPG4	Q8N801	248 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TMEM106A	Q96A25	262 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PEBP4	Q96S96	227 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	GINS3	Q9BRX5	216 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ZNF670	Q9BS34	389 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ALG12	Q9BV10	488 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	RBKS	Q9H477	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077		A4D1N5	150 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ECI2	O75521	394 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PGA4	P0DJD7	388 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PGA5	P0DJD9	388 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PGAM2	P15259	253 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	MMP11	P24347	488 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	NMBR	P28336	390 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ARL3	P36405	182 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SNCA	P37840	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	AQP2	P41181	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR12D2	P58182	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TAS2R19	P59542	299 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	CKS1B	P61024	79 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	RAB11A	P62491	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	RHOG	P84095	191 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	KIAA0040	Q15053	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SYPL1	Q16563	259 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	C1orf189	Q5VU69	101 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TRNP1	Q6NT89	227 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	REEP3	Q6NUK4	255 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	OR5W2	Q8NH69	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	FGF13	Q92913	245 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	DUSP16	Q9BY84	665 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	CUTC	Q9NTM9	273 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SCML2	Q9UQR0	700 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077		A0A0B4J2A0	478 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	LILRA5	A6NI73	299 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077		K7EPK0	472 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	SPINT2	O43291	252 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TBX19	O60806	448 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	LDB3	O75112	727 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	NKX2-2	O95096	273 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MED17-223	ENST00000640077	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms