RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	DDI2	Q5TDH0	399 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF561	Q8N587	486 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TEX29	Q8N6K0	151 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	UPRT	Q96BW1	309 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	WDFY2	Q96P53	400 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	NOX4	Q9NPH5	578 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ING4	Q9UNL4	249 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PQ09	198 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	SIRPB1	O00241	398 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	KDM4B	O94953	1096 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CDRT1	O95170	752 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TK1	P04183	234 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	MAS1	P04201	325 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CD1A	P06126	327 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	LIPF	P07098	398 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CHRM2	P08172	466 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CAV3	P56539	151 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	BDH1	Q02338	343 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	SCN1B	Q07699	218 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ACSM1	Q08AH1	577 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		Q8IYB0	196 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	LHX4	Q969G2	390 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM203	Q969S6	136 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	DERL3	Q96Q80	235 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	MDFI	Q99750	246 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CHST6	Q9GZX3	395 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	SIRPD	Q9H106	197 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		Q9H521	79 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	HMG20A	Q9NP66	347 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PRD5	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PRF3	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PRM7	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR37	O15354	613 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF737	O75373	536 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	VENTX	O95231	258 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	GABRR1	P24046	479 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ERVFRD-1	P60508	538 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	EDDM3A	Q14507	147 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		Q8N7P7	452 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	UFD1	Q92890	307 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CKLF	Q9UBR5	152 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		K7N7A8	449 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TCF21	O43680	179 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	PSPN	O60542	156 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	HTR3B	O95264	441 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ALDOB	P05062	364 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	FPR2	P25090	351 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	EDDM3B	P56851	147 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	KLRD1	Q13241	179 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PP11	408 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	GPX5	O75715	221 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	OR2H2	O95918	312 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF44	P15621	663 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	CCL3L1	P16619	93 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	FST	P19883	344 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	PTGFR	P43088	359 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF273	Q14593	569 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF146	Q15072	292 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	RSU1	Q15404	277 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	GRK1	Q15835	563 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR157	Q5UAW9	335 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ARID1B-222	ENST00000637003	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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