RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 SCTP09683 121 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 GCH1P30793 250 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 CALCRP30988 508 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PTGS2P35354 604 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FAM3AP98173 230 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PP6455Q8WZ26 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ZPBPQ9BS86 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 BCO1Q9HAY6 547 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ZNF716A6NP11 495 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ALX3O95076 343 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PDGFAP04085 211 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 CD63P08962 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ID4P47928 161 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FAM201AQ5SY85 155 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 WIPF3A6NGB9 483 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 CTDSPLO15194 276 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SERPINE2P07093 398 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IFI6P09912 130 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 RAB6AP20340 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PSMB6P28072 239 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 THBS4P35443 961 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FOXF2Q12947 444 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR6S1Q8NH40 331 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 GPR87Q9BY21 358 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 WNT9BO14905 357 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ISG15P05161 165 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ZNF806P0C7X5 589 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 GABRA1P14867 456 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 NFYBP25208 207 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 TAS2R46P59540 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 H3F3AP84243 136 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FOXO1Q12778 655 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 NABP1Q96AH0 204 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 KIRREL1Q96J84 757 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR10C1Q96KK4 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 EML5Q05BV3 1969 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 A0A1W2PPE3 182 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 K7EPK0 472 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 NME2P1O60361 137 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IGKV1D-12P01611 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IAPPP10997 89 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR8G1Q15617 311 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR5T1Q8NG75 326 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 MED6O75586 246 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 C1QL1O75973 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IFNA2P01563 188 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IGHMP01871 453 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 IL2RGP31785 369 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 LHX2P50458 406 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-217ENST00000628904 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms