RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 K7N7A8 449 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-207ENST00000589585 M0R1W7 72 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-207ENST00000589585 HAND1O96004 215 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-207ENST00000589585 IGKV1D-12P01611 117 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-207ENST00000589585 GABRR1P24046 479 aa11.28□□□□□ -0.6
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CTIF-207ENST00000589585 A0A1W2PRV1 198 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 HAX1O00165 279 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 SIRPB1O00241 398 aa11.25□□□□□ -0.61
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CTIF-207ENST00000589585 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 RIPK1Q13546 671 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 ZNF273Q14593 569 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 Q499Y3 187 aa11.25□□□□□ -0.61
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