RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	PXT1	Q8NFP0	134 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	HMG20A	Q9NP66	347 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	METRN	Q9UJH8	293 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	HAND1	O96004	215 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	MYL9	P24844	172 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	COL10A1	Q03692	680 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SCN1B	Q07699	218 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CD276	Q5ZPR3	534 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF561	Q8N587	486 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	MMP26	Q9NRE1	261 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	STUB1	Q9UNE7	303 aa		20.71	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ADRA2C	P18825	462 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	MTNR1B	P49286	362 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	C22orf42	Q6IC83	251 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SDSL	Q96GA7	329 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	RHOF	Q9HBH0	211 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SSR3	Q9UNL2	185 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		20.7	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SIRPB1	O00241	398 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CD36	P16671	472 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	HNF1A	P20823	631 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	HIVEP2	P31629	2446 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	C22orf46	C9J442	243 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SH2D1B	O14796	132 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	FCN3	O75636	299 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CHRM2	P08172	466 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF44	P15621	663 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GABRR1	P24046	479 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	BMX	P51813	675 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	FGF12	P61328	243 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CDH26	Q8IXH8	852 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	MRI1	Q9BV20	369 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	OR51E2	Q9H255	320 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		20.68	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GATA3	P23771	443 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	PDCD1	Q15116	288 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		20.67	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQ09	198 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GADD45A	P24522	165 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF146	Q15072	292 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	PIGY	Q3MUY2	71 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	OSR2	Q8N2R0	312 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CHST6	Q9GZX3	395 aa		20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229		J3QLI3	93 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	PDCD5	O14737	125 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GPR37	O15354	613 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	OR2H2	O95918	312 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	TK1	P04183	234 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM18	P0DKX4	95 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GAL	P22466	123 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	CAV3	P56539	151 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	GPR176	Q14439	515 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ELP2	Q6IA86	826 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	BEX2	Q9BXY8	128 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	IL36G	Q9NZH8	169 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PP11	408 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	DEGS1	O15121	323 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	HTR2C	P28335	458 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	EDDM3B	P56851	147 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	EDDM3A	Q14507	147 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	GRK1	Q15835	563 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	ASCL4	Q6XD76	172 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		20.64	■□□□□ 0.89
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		20.64	■□□□□ 0.89

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