RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 SNTNA6NMZ2 147 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 C17orf98A8MV24 154 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SIRPB1O00241 398 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 CHST1O43916 411 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 TSPAN15O95858 294 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 PRKACBP22694 351 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 PEX2P28328 305 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 RAB13P51153 203 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ACTA2P62736 377 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ACTG2P63267 376 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FAM189A2Q15884 450 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SSX2Q16385 188 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OCLNQ16625 522 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 UTS2BQ765I0 119 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 RNF144BQ7Z419 303 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 Q8IYB0 196 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SNX22Q96L94 193 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF714Q96N38 554 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OPALINQ96PE5 141 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 MMP27Q9H306 513 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 NEK6Q9HC98 313 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 AMBNQ9NP70 447 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 HHLA2Q9UM44 414 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.37□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 hADV38S2A0JD32 116 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ODF3BA8MYP8 253 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 E9PQ18 207 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 PSPNO60542 156 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 GABRB1P18505 474 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OR3A1P47881 315 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 EFNB2P52799 333 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 AANATQ16613 207 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 LPCAT4Q643R3 524 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FDX2Q6P4F2 183 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM219Q86XT9 240 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SLC29A1Q99808 456 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 S100A14Q9HCY8 104 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 RAB18Q9NP72 206 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 GLS2Q9UI32 602 aa7.36□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FAM172BPA6NC97 362 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 E9PI62 339 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 BAG2O95816 211 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 OR2H2O95918 312 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 IGKV1D-12P01611 117 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ISG15P05161 165 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 HCKP08631 526 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF44P15621 663 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 CCR9P51686 369 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 P2RX3P56373 397 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SLC34A1Q06495 639 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 SCN1BQ07699 218 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 GALEQ14376 348 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF146Q15072 292 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF626Q68DY1 528 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 Q6ZTK2 550 aa7.35□□□□□ -1.23
MFGE8-213ENST00000560553 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms