RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 H7C417 338 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PLPP2O43688 288 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 RAMP1O60894 148 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DQA2P01906 255 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CTXN2P0C2S0 81 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CCL3P10147 92 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 COX6A1P12074 109 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 FUT1P19526 365 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 IFNGR2P38484 337 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CRYBA4P53673 196 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ERVFRD-1P60508 538 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 FUT7Q11130 342 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 DUSP8Q13202 625 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ELOBQ15370 118 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 SLC35G3Q8N808 338 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 DCUN1D4Q92564 292 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 GHSRQ92847 366 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 HARBI1Q96MB7 349 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 SYT3Q9BQG1 590 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 GPR87Q9BY21 358 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 C1orf198Q9H425 327 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 C21orf140B9A014 251 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PMS2P2O95744 297 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 DPP4P27487 766 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TNFSF10P50591 281 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TAS2R20P59543 309 aa6.36□□□□□ -1.39
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ROBO1-211ENST00000498428 PAX5Q02548 391 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PCOLCEQ15113 449 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 OR1Q1Q15612 314 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 OR1C1Q15619 314 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.36□□□□□ -1.39
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ROBO1-211ENST00000498428 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.36□□□□□ -1.39
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ROBO1-211ENST00000498428 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 GFI1Q99684 422 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.36□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 MSGN1A6NI15 193 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 J3QRE1 110 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TSPAN2O60636 221 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 NKX2-2O95096 273 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ONECUT2O95948 504 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 PGCP20142 388 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CD34P28906 385 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 S100A10P60903 97 aa6.35□□□□□ -1.39
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ROBO1-211ENST00000498428 FUT5Q11128 374 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 CARD17Q5XLA6 110 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF550Q7Z398 422 aa6.35□□□□□ -1.39
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ROBO1-211ENST00000498428 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 STACQ99469 402 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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ROBO1-211ENST00000498428 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 MED31Q9Y3C7 131 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1B0GWA3 101 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PNR3 127 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 FRG2CA6NGY1 282 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 J3QLW9 94 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 SIVA1O15304 175 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 KLF4O43474 513 aa6.35□□□□□ -1.39
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF19P17023 458 aa6.35□□□□□ -1.39
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