RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SATL1	Q86VE3	508 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SGCD	Q92629	289 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP19	Q96LK0	163 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	GAFA1	Q96PS6	74 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5M11	Q96RB7	305 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	GLS2	Q9UI32	602 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF222	Q9UK12	451 aa		14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNGR1	O43759	233 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA7	O95182	113 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRA2	P47869	451 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	POU3F4	P49335	361 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	DYRK2	Q92630	601 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGR1B	Q92637	280 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A13	Q99584	98 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	MGLL	Q99685	303 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOF	Q9HBH0	211 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		14.21	□□□□□ -0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDOB	P05062	364 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MELTF	P08582	738 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM225B	P0DP42	221 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG2	P11465	335 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BDKRB2	P30411	391 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFBR2	P37173	567 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP2K4	P45985	399 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BLMH	Q13867	455 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KISS1	Q15726	138 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CALHM1	Q8IU99	346 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF561	Q8N587	486 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LHX4	Q969G2	390 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR14A2	Q96R54	314 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED9	Q9BVK6	235 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		14.2	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPH5	198 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MEGF11	A6BM72	1044 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBA1	P05813	215 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CPE	P16870	476 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	IER3	P46695	156 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BMX	P51813	675 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2E1	P51965	193 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TPBG	Q13641	420 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DOC2B	Q14184	412 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DGUOK	Q16854	277 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR31	Q5SQ13	230 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4F5	Q8NH21	305 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF14	Q92956	283 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SLAMF9	Q96A28	289 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SEH1L	Q96EE3	360 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DUX5	Q96PT3	197 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BEX1	Q9HBH7	125 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HES4	Q9HCC6	221 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		14.19	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX5	O75715	221 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KNG1	P01042	644 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FBP1	P09467	338 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK11-1	P61568	191 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	IKZF1	Q13422	519 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DDI2	Q5TDH0	399 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF773	Q6PK81	442 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N7P7	452 aa		14.18	□□□□□ -0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		14.18	□□□□□ -0.14

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