RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PPK0	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	FSHB	P01225	129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	SELL	P14151	372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	SRM	P19623	302 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	LMO1	P25800	156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	PSMB9	P28065	219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	OR3A4P	P47883	348 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	GMFB	P60983	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	CR1L	Q2VPA4	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290		K7N7A8	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFB3	O43676	98 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	CRLF1	O75462	422 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	LIPF	P07098	398 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	CHRM2	P08172	466 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	GPER1	Q99527	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	HAND1	O96004	215 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	TFF1	P04155	84 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	MAS1	P04201	325 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	PRKACA	P17612	351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	PAX5	Q02548	391 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6P435	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	GFI1	Q99684	422 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC22A1	O15245	554 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	AVP	P01185	164 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	TK1	P04183	234 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	CSN2	P05814	226 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	MMP9	P14780	707 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	GABRA2	P47869	451 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	IKZF1	Q13422	519 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR176	Q14439	515 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SNX22	Q96L94	193 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-208	ENST00000487290	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms