RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485943.1

USP40-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 4

Gene USP40, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-216ENST00000485943 SIGLEC5O15389 551 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 KDM4BO94953 1096 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 KNG1P01042 644 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 IGLV3-1P01715 115 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 MAS1P04201 325 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 CRYBA1P05813 215 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PGA5P0DJD9 388 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PSG2P11465 335 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 MYL9P24844 172 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ACTG1P63261 375 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 GPR176Q14439 515 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PDCD1Q15116 288 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 NUP50Q9UKX7 468 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.69□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 VPS13CQ709C8 3753 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 A0A1W2PPK0 400 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 SIRPB1O00241 398 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 DEGS1O15121 323 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ANGPTL7O43827 346 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ARL6IP5O75915 188 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 HAND1O96004 215 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 CALCBP10092 127 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 BCL3P20749 454 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 SERPINA2P20848 420 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PSMB9P28065 219 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 BDH1Q02338 343 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 TMEM42Q69YG0 159 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 CALHM1Q8IU99 346 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 HSPB6O14558 160 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 OGG1O15527 345 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 MT-ND2P03891 347 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 DUSP1P28562 367 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 MTNR1BP49286 362 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ARHGDIBP52566 201 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 CAV3P56539 151 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 BPIFB3P59826 476 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 GABARAPL2P60520 117 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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