RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GLS2	Q9UI32	602 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	HAND1	O96004	215 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	FSHB	P01225	129 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-12	P01611	117 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	BDKRB2	P30411	391 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ACSM1	Q08AH1	577 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	IRF3	Q14653	427 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	GPR157	Q5UAW9	335 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF529	Q6P280	563 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A7	Q99884	636 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF69	Q9UC07	566 aa		14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	GABRP	O00591	440 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	KDM4B	O94953	1096 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TK1	P04183	234 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CD1A	P06126	327 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	GABRR1	P24046	479 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TGFBR2	P37173	567 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MAP2K4	P45985	399 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZP1	P60852	638 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SCN1B	Q07699	218 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	UFD1	Q92890	307 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	LHX4	Q969G2	390 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	HMG20A	Q9NP66	347 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		14.64	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SH2D1B	O14796	132 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ALDOB	P05062	364 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	BLMH	Q13867	455 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PDCD1	Q15116	288 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	RSU1	Q15404	277 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PHC2	Q8IXK0	858 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	THRSP	Q92748	146 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	DERL3	Q96Q80	235 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TBX15	Q96SF7	602 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	S100A13	Q99584	98 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SIRPD	Q9H106	197 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	NOX4	Q9NPH5	578 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ING4	Q9UNL4	249 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	KPTN	Q9Y664	436 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		14.63	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902		K7N7A8	449 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SIRPB1	O00241	398 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MAS1	P04201	325 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MMP9	P14780	707 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PTGFR	P43088	359 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR3A4P	P47883	348 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	EDDM3B	P56851	147 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	EDDM3A	Q14507	147 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TMEM203	Q969S6	136 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SNX22	Q96L94	193 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CHST6	Q9GZX3	395 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	RHOF	Q9HBH0	211 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		14.62	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPH5	198 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CDRT1	O95170	752 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	HTR3B	O95264	441 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF44	P15621	663 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	FST	P19883	344 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	INSL4	Q14641	139 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF146	Q15072	292 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	GRK1	Q15835	563 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PXT1	Q8NFP0	134 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		14.61	□□□□□ -0.07

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