RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DEGS1O15121 323 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS5O15539 181 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 APOA1P02647 267 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CD80P33681 288 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A5P33763 92 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PITPNBP48739 271 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGYQ3MUY2 71 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM201AQ5SY85 155 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB12Q6IQ22 244 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF525Q8N782 197 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CHST4Q8NCG5 386 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM168AQ92567 244 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 Q96M66 194 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCG5Q9H222 651 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNK15Q9H427 330 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DIABLOQ9NR28 239 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ISPDA4D126 451 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM25AB3EWG3 89 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM25CB3EWG5 89 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM25GB3EWG6 89 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CTDSP2O14595 271 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 HPGDSO60760 199 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CLPXO76031 633 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF205O95201 554 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 HAND1O96004 215 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV2-70P01814 119 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PSG2P11465 335 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF44P15621 663 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRR1P24046 479 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GIFP27352 417 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PRDX2P32119 198 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TALDO1P37837 337 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRA2P47869 451 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 EFNB2P52799 333 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IKZF1Q13422 519 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL6IP1Q15041 203 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZMYND11Q15326 602 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TAF9Q16594 264 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 STUMQ69YW2 141 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SPICQ8N5J4 248 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SEH1LQ96EE3 360 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MED30Q96HR3 178 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GAL3ST1Q99999 423 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT22Q9H7X7 185 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM165Q9HC07 324 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PDCD6O75340 191 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2H2O95918 312 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GYPAP02724 150 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 GLAP06280 429 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 FUT3P21217 361 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LMO1P25800 156 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP1P28562 367 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 VEGFCP49767 419 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SCN1BQ07699 218 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G7Q13093 441 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SHEQ5VZ18 495 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6P435 159 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF561Q8N587 486 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms