RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0U1RQK1 487 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPK0 400 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM89A2RUT3 159 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 MEGF11A6BM72 1044 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM212A6NML5 194 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 K7N7A8 449 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC1A7O00341 560 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 PIN1P1O15428 100 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 GATBO75879 557 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP23AO75900 390 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 ECDO95905 644 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA3P01011 423 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 KNG1P01042 644 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1-69P01742 117 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-ND2P03891 347 aa5.73□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 FPR2P25090 351 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 RBP2P50120 134 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1B3P54709 279 aa5.73□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.73□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 AHSA2Q719I0 299 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD9Q8NE22 299 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52N1Q8NH53 320 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 OPALINQ96PE5 141 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5M11Q96RB7 305 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 CHST6Q9GZX3 395 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 KPTNQ9Y664 436 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PP11 408 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGES3LE9PB15 166 aa5.72□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 KDM4BO94953 1096 aa5.72□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 HAND1O96004 215 aa5.72□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 MELTFP08582 738 aa5.72□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRTN3P24158 256 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 OR3A1P47881 315 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPZA1P52907 286 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 BAMBIQ13145 260 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF3Q14653 427 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF146Q15072 292 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 KISS1Q15726 138 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 UTF1Q5T230 341 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR157Q5UAW9 335 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6YL49 198 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF561Q8N587 486 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX29Q8N6K0 151 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 GHSRQ92847 366 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM19Q96E16 107 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 HMG20AQ9NP66 347 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 DHDHQ9UQ10 334 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQ09 198 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.71□□□□□ -1.5
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