RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 IL13RA2Q14627 380 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM189A2Q15884 450 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM155Q4W5P6 130 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00596Q86U02 117 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 OR5T2Q8NGG2 359 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 OR14J1Q9UGF5 321 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PDZD2O15018 2839 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 RFPL4AA6NLU0 287 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 RAB6AP20340 208 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PIGYQ3MUY2 71 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 STUMQ69YW2 141 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 MZT2AQ6P582 158 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SPICQ8N5J4 248 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 ANGPTL6Q8NI99 470 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 POM121Q96HA1 1249 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM246Q9BRR3 403 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 GYPAP02724 150 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 Q96M66 194 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 DNTTIP1Q9H147 329 aa23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SH2D1BO14796 132 aa23.23■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A16P16260 332 aa23.23■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 CPT2P23786 658 aa23.23■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 NR4A2P43354 598 aa23.23■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 DCDC5Q6ZRR9 648 aa23.23■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 GAL3ST1Q99999 423 aa23.23■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 VWC2LB2RUY7 222 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 HAND1O96004 215 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 GABRA2P47869 451 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 ART1P52961 327 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 MPV17LQ2QL34 196 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A10PA6NDY2 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A18PA6NE21 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A16PA6NEW6 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 NKX6-3A6NJ46 265 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A7PA6NKC0 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A22PA8MWA6 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A12PA8MX19 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A15PP0C7V4 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A13PP0C7W8 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A14PP0C7W9 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A24PP0C7X0 464 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 DUSP1P28562 367 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PRDX2P32119 198 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 OR5H6Q8NGV6 325 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 TM2D1Q9BX74 207 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 COMMD3Q9UBI1 195 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF222Q9UK12 451 aa23.22■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 IKZF1Q13422 519 aa23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 TAF9Q16594 264 aa23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 LPAR5Q9H1C0 372 aa23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF665Q9H7R5 613 aa23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB10Q9UN67 800 aa23.21■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 METTL21EPA6NDL7 271 aa23.2■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 H3BUI4 141 aa23.2■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CHRM2P08172 466 aa23.2■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 MIOXQ9UGB7 285 aa23.2■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CEACAM18A8MTB9 384 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF44P15621 663 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 GABRR1P24046 479 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 EFNB2P52799 333 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G7Q13093 441 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF788Q6ZQV5 615 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CD177Q8N6Q3 437 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD12Q8N8I0 201 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CHST4Q8NCG5 386 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SDSLQ96GA7 329 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 RHBDL2Q9NX52 303 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 KAAG1Q9UBP8 84 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 A0A075B6Q4 140 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 DEGS1O15121 323 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 TMPRSS2O15393 492 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 OR2H2O95918 312 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 SCN1BQ07699 218 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2NLQ5JXB2 153 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF561Q8N587 486 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 MCFD2Q8NI22 146 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 MED30Q96HR3 178 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CMTM3Q96MX0 182 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 CCL13Q99616 98 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 NARFLQ9H6Q4 476 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 IFT22Q9H7X7 185 aa23.19■■□□□ 1.3
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM20O43506 726 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms