RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM200BQ69YZ2 307 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF529Q6P280 563 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNKDQ8N490 385 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM19Q96E16 107 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBN3Q75N90 2809 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM4BO94953 1096 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCKP08631 526 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 HKR1P10072 659 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALCBP10092 127 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL3L1P16619 93 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP4P55087 323 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZP1P60852 638 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED21Q13503 144 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCP5Q6MZN7 132 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHSA2Q719I0 299 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8H2Q8N162 312 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR148Q8TDV2 347 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK6Q9HC98 313 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMG20AQ9NP66 347 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R4Q9NYW5 299 aa16■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRD5 423 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRF3 423 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRM7 423 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPFFO15130 113 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP1P28562 367 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOC2BQ14184 412 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF146Q15072 292 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 KISS1Q15726 138 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 AWAT1Q58HT5 328 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM86BQ8N661 226 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX22Q96L94 193 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPH5 198 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB3AP20336 220 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAA4P35542 130 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2E1P51965 193 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLX6P56179 175 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF23Q7RTU1 214 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM106AQ96A25 262 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHIAQ9BZP6 476 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 POMT1Q9Y6A1 747 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0YJX3 145 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSPNO60542 156 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-59P01825 116 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD2P06729 351 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFPP27918 469 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDDM3BP56851 147 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf87Q6PH81 154 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GHSRQ92847 366 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST6Q9GZX3 395 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEIOCA2RUB1 952 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRPB1O00241 398 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRPO00591 440 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBP1P09467 338 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM225BP0DP42 221 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRR1P24046 479 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR3A1P47881 315 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVFRD-1P60508 538 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDDM3AQ14507 147 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRK1Q15835 563 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX19Q8N4C7 294 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORAI1Q96D31 301 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOFQ9HBH0 211 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms