RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261707.7

SLC6A4-201, Transcript of solute carrier family 6 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A4, Length 6,604 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4-201ENST00000261707 NMBP08949 121 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 FUT6P51993 359 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 OR4C46A6NHA9 309 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 NDUFB3O43676 98 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 PRF1P14222 555 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 FAHP16930 419 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 BSGP35613 385 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 PYCR3Q53H96 274 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 MED29Q9NX70 200 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 IFT172Q9UG01 1749 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 CORTO00230 105 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 LINC01565O15544 149 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 FZD2Q14332 565 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 C5orf49A4QMS7 147 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 UPK1AO00322 258 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 RNF224P0DH78 156 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 CACNG5Q9UF02 275 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 SPRY3O43610 288 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 CDC14BO60729 498 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ZFPL1O95159 310 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 FUT7Q11130 342 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ASB16Q96NS5 453 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 LTN1O94822 1766 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 PDE6DO43924 150 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 PF4P02776 101 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 BRS3P32247 399 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 HERVK_113P61574 105 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC6A4-201ENST00000261707 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 A1L4Q6 167 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 ICOSLGO75144 302 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 CD3EP07766 207 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 FAM157BP0CG42 384 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 WNT3P56703 355 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 OR2A5Q96R48 311 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 A0A1W2PN81 502 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 FGF17O60258 216 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 FUT3P21217 361 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 LPAR6P43657 344 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 MOB3AQ96BX8 217 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 HAND1O96004 215 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 SSX8Q7RTT4 187 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 OXGR1Q96P68 337 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 KCNK15Q9H427 330 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 SOD3P08294 240 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 PGA4P0DJD7 388 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 PGA5P0DJD9 388 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC6A4-201ENST00000261707 NMUP48645 174 aa9.58□□□□□ -0.88
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