RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9920D3YVZ2 140 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc38a6G3UVW3 457 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtnd4lP03903 98 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HbzP06467 142 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pitx2P97474 317 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptp4a1Q63739 173 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tfap2eQ6VUP9 442 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1111Q7TR55 312 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fahd1Q8R0F8 227 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SccpdhQ8R127 429 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr678Q8VG26 313 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfpl4aQ8VH31 287 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a12Q8VIE6 465 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifitm3Q9CQW9 137 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hacd1Q9QY80 281 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AgmatA2AS89 358 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3072F6SKY8 209 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17654F7AXR3 209 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thbs3Q05895 956 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gfod1Q3UHD2 390 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St8sia4Q64692 359 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab35Q6PHN9 201 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AardQ811W1 167 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdhr3Q8BL00 831 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr137bQ8BNQ3 385 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Henmt1Q8CAE2 395 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fate1Q8CEK7 99 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klf17Q8CFA7 341 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cacng5Q8VHW4 275 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhga3Q91XY5 928 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CQ90 155 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Magt1Q9CQY5 335 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ift22Q9DAI2 185 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gstz1Q9WVL0 216 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs11Q9Z2H1 443 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6665F6Y363 85 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msl3l2G3X992 371 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21976J3QNN2 249 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21767J3QPV5 180 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5458L7N219 204 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cr2P19070 1025 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfrsf1aP25118 454 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alox5apP30355 161 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Icam2P35330 277 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf9P54130 208 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pafah1b3Q61205 232 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr788Q8VFI0 311 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1466Q8VFW4 310 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CWB7 115 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptp4a3Q9D658 173 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubl3Q9Z2M6 117 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20834J3QM72 227 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sp100O35892 482 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ear2P97425 156 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5111Q8C9M4 190 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Duoxa1Q8VE49 341 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1240Q8VG73 314 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MrnipQ9D1F5 335 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lmntd1Q9D4C1 413 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr944Q9EQ91 311 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RhcgQ9QXP0 498 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa11.44□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxd9P28357 339 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasd2P63032 266 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FrzbP97401 323 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo27Q6DIA9 280 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh24Q6PFX6 781 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1212Q7TR08 311 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tctn1Q8BZ64 593 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SowahbQ8BZW2 760 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1241Q8VF91 314 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Maf1Q9D0U6 258 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r129E9QA94 307 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8720K9J7F4 307 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SncaO55042 140 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hbb-yP02104 147 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P18524 117 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxc11P31313 304 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubac2Q8R1K1 345 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 V1ra11Q8R2E6 318 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ntng2Q8R4F1 589 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r45Q8VIC7 318 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acp1Q9D358 158 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps34Q9JIK9 218 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt11Q9R0N3 430 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abca7Q91V24 2159 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm37240E9QAY5 252 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnj15O88932 375 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Npepl1Q6NSR8 524 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1061Q7TR72 313 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk35Q80ZW0 539 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mob3cQ8BJG4 216 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dync2li1Q8K0T2 351 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 StradbQ8K4T3 418 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr974Q8VH09 310 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiss1rQ91V45 396 aa11.43□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3676D3Z236 184 aa11.42□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdh17E9PXF0 1157 aa11.42□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3573L7N292 184 aa11.42□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lhfpl2Q8BGA2 222 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.6 ms