Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA2

Lhfpl2, LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl2Q8BGA2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Lhfpl2Q8BGA2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lhfpl2Q8BGA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lhfpl2Q8BGA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lhfpl2Q8BGA2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lhfpl2Q8BGA2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lhfpl2Q8BGA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lhfpl2Q8BGA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lhfpl2Q8BGA2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lhfpl2Q8BGA2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lhfpl2Q8BGA2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lhfpl2Q8BGA2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lhfpl2Q8BGA2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lhfpl2Q8BGA2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lhfpl2Q8BGA2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lhfpl2Q8BGA2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lhfpl2Q8BGA2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lhfpl2Q8BGA2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lhfpl2Q8BGA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lhfpl2Q8BGA2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lhfpl2Q8BGA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lhfpl2Q8BGA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lhfpl2Q8BGA2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lhfpl2Q8BGA2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lhfpl2Q8BGA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lhfpl2Q8BGA2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lhfpl2Q8BGA2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lhfpl2Q8BGA2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lhfpl2Q8BGA2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lhfpl2Q8BGA2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lhfpl2Q8BGA2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lhfpl2Q8BGA2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lhfpl2Q8BGA2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lhfpl2Q8BGA2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lhfpl2Q8BGA2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lhfpl2Q8BGA2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lhfpl2Q8BGA2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lhfpl2Q8BGA2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lhfpl2Q8BGA2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lhfpl2Q8BGA2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lhfpl2Q8BGA2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lhfpl2Q8BGA2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lhfpl2Q8BGA2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhfpl2Q8BGA2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhfpl2Q8BGA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhfpl2Q8BGA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lhfpl2Q8BGA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lhfpl2Q8BGA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lhfpl2Q8BGA2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lhfpl2Q8BGA2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lhfpl2Q8BGA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhfpl2Q8BGA2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lhfpl2Q8BGA2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lhfpl2Q8BGA2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lhfpl2Q8BGA2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lhfpl2Q8BGA2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lhfpl2Q8BGA2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lhfpl2Q8BGA2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lhfpl2Q8BGA2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lhfpl2Q8BGA2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lhfpl2Q8BGA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhfpl2Q8BGA2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhfpl2Q8BGA2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhfpl2Q8BGA2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhfpl2Q8BGA2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhfpl2Q8BGA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhfpl2Q8BGA2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhfpl2Q8BGA2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhfpl2Q8BGA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhfpl2Q8BGA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhfpl2Q8BGA2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhfpl2Q8BGA2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lhfpl2Q8BGA2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhfpl2Q8BGA2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhfpl2Q8BGA2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhfpl2Q8BGA2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhfpl2Q8BGA2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhfpl2Q8BGA2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhfpl2Q8BGA2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhfpl2Q8BGA2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhfpl2Q8BGA2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhfpl2Q8BGA2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhfpl2Q8BGA2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhfpl2Q8BGA2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhfpl2Q8BGA2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lhfpl2Q8BGA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhfpl2Q8BGA2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhfpl2Q8BGA2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhfpl2Q8BGA2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lhfpl2Q8BGA2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhfpl2Q8BGA2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhfpl2Q8BGA2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhfpl2Q8BGA2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms