RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ENOPH1Q9UHY7 261 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 FBXO5Q9UKT4 447 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SLIT3O75094 1523 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 KIAA0556O60303 1618 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CD163L1Q9NR16 1453 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 WNK3Q9BYP7 1800 aa2.96□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MROH2AA6NES4 1674 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 OR6C74A6NCV1 312 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 NDUFS8O00217 210 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ORC5O43913 435 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MPDU1O75352 247 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 VAPBO95292 243 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TDP2O95551 362 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF806P0C7X5 589 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SMIM6P0DI80 62 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ERGP11308 486 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 HLA-EP13747 358 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ADRB3P13945 408 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF17P17021 662 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ELK1P19419 428 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 OMGP23515 440 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 GABRR2P28476 465 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CD79BP40259 229 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RPS9P46781 194 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PSMD8P48556 350 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RAB7AP51149 207 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PSME3P61289 254 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 DEFA6Q01524 100 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 INCA1Q0VD86 236 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CDH17Q12864 832 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 BTN1A1Q13410 526 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 GABRA6Q16445 453 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RPEL1Q2QD12 228 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CLLU1Q5K131 121 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TPRG1LQ5T0D9 272 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ERICH5Q6P6B1 374 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TIFABQ6ZNK6 161 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SNX20Q7Z614 316 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 FAM58AQ8N1B3 248 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TMEM35BQ8NCS4 154 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 OR10G4Q8NGN3 311 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 NDNFQ8TB73 568 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ZFP90Q8TF47 636 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 LRRC29Q8WV35 223 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ASZ1Q8WWH4 475 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ROPN1LQ96C74 230 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF251Q9BRH9 671 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SPNS1Q9H2V7 528 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MED11Q9P086 117 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SLC17A7Q9P2U7 560 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CTSFQ9UBX1 484 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PRO0461Q9UI25 63 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MRC1P22897 1456 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MRC2Q9UBG0 1479 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MYH1P12882 1939 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MYH2Q9UKX2 1941 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PIK3C2AO00443 1686 aa2.95□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TULP4Q9NRJ4 1543 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SPEF2Q9C093 1822 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 A0A1W2PRF3 423 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 A0A1W2PRM7 423 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 DHRS12A0PJE2 317 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CLDN24A6NM45 220 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 BBIP1A8MTZ0 92 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 EFCAB9A8MZ26 197 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ANKRD63C9JTQ0 380 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 E5RI56 91 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 K7EMT4 169 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RAD1O60671 282 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 GABARAPO95166 117 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ETHE1O95571 254 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 DHFRP00374 187 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 HLA-DPB1P04440 258 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 IFI30P13284 250 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RAB5AP20339 215 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 MYL9P24844 172 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 NBL1P41271 181 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 INPP1P49441 399 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 P2RX1P51575 399 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 CLDN6P56747 220 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 PPP1CBP62140 327 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ARG2P78540 354 aa2.94□□□□□ -1.94
PRPF39-210ENST00000556718 ERCC8Q13216 396 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms