RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497465.1

ELL3-206, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 2

Gene ELL3, Length 964 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-206	ENST00000497465	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZNF250	P15622	560 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	NPR2	P20594	1047 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PRKACG	P22612	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PAX6	P26367	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	GIF	P27352	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	KDELR2	P33947	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	EVX1	P49640	407 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CRYBA2	P53672	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SMIM11A	P58511	58 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	TSPAN5	P62079	268 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OPCML	Q14982	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	FCN2	Q15485	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SSX1	Q16384	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZNF74	Q16587	644 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	RNF212	Q495C1	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	LRR1	Q96L50	414 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	MCHR1	Q99705	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SGCE	O43556	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	UBL3	O95164	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	OR2C1	O95371	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SERPINA3	P01011	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	THY1	P04216	161 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	TACSTD2	P09758	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	ZNF35	P13682	527 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	DAO	P14920	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	SPI1	P17947	270 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	AHCY	P23526	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	IL2RG	P31785	369 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	S100A11	P31949	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CRYBB2	P43320	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ELL3-206	ENST00000497465	GZMM	P51124	257 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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