RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1B0GV72	72 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1W2PRD5	423 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CLDN34	H7C241	214 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SULT1C2	O00338	296 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACOX3	O15254	700 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC16A4	O15374	487 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SOCS1	O15524	211 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PFDN1	O60925	122 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	AQP8	O94778	261 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDRT1	O95170	752 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	APOC1	P02654	83 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	APCS	P02743	223 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	IFNW1	P05000	195 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	GUSB	P08236	651 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD36	P16671	472 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	HLA-G	P17693	338 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB3A	P20336	220 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	MPI	P34949	423 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OPRK1	P41145	380 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TAS2R60	P59551	318 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	AP1S1	P61966	158 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFRSF9	Q07011	255 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	AES	Q08117	197 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SELENBP1	Q13228	472 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBTB6	Q15916	424 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BSX	Q3C1V8	233 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	AVPI1	Q5T686	147 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	IDNK	Q5T6J7	187 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	LPCAT4	Q643R3	524 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	STUM	Q69YW2	141 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF738	Q8NE65	137 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR8U1	Q8NH10	309 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR5B3	Q8NH48	314 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ISOC2	Q96AB3	205 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSC22D3	Q99576	134 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C1orf109	Q9NX04	203 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		V9GYY9	64 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	JCAD	Q9P266	1359 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PBRM1	Q86U86	1689 aa		2.56	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF98	A6NK75	572 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		H0Y980	276 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SMKR1	H3BMG3	65 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	DFFA	O00273	331 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCRL2	O00421	344 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	HLA-DQA1	P01909	254 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TCRB	P04435	133 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACSM4	P0C7M7	580 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	LINC00614	P0C842	121 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CT45A6	P0DMU7	189 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CT45A5	P0DMU8	189 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CT45A7	P0DMV0	189 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SSTR5	P35346	364 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CSK	P41240	450 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAGEA12	P43365	314 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR1	P46091	355 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	AP1S2	P56377	157 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TPBG	Q13641	420 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRIQK	Q629K1	86 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPESP1	Q6UW49	350 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	AHSA2	Q719I0	299 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.55	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	METTL13	Q8N6R0	699 aa		2.55	□□□□□ -2

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