RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GUSBP1Q15486 140 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PGAP1Q75T13 922 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DOK3Q7L591 496 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM123Q8N131 208 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR1S1Q8NH92 325 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 AQP3Q92482 292 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF799Q96GE5 643 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TRIB1Q96RU8 372 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ATG101Q9BSB4 218 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TREM1Q9NP99 234 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MED9Q9NWA0 146 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 VSIG4Q9Y279 399 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TSTD3H0UI37 97 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR2A4O95047 310 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 VAMP5O95183 116 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CD37P11049 281 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FCGR2AP12318 317 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 S100A11P31949 105 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CYB561P49447 251 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF84P51523 738 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DHRS2Q13268 280 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 AARDQ4LEZ3 155 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF774Q6NX45 483 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR10D3Q8NH80 312 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ABHD3Q8WU67 409 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NABP1Q96AH0 204 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAB3CQ96E17 227 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR2A7Q96R45 310 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 UPB1Q9UBR1 384 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FRYQ5TBA9 3013 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PLSCR5A0PG75 271 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SOX15O60248 233 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CRHP06850 196 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PI3P19957 117 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAB6AP20340 208 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 KISS1Q15726 138 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 UBE2V2Q15819 145 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DCAF10Q5QP82 559 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 KCTD9Q7L273 389 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 AAED1Q7RTV5 226 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 REC114Q7Z4M0 266 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CCDC107Q8WV48 283 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CST11Q9H112 138 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LRFN1Q9P244 771 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 A0A0A6YYH2 397 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 A6NJ64 397 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR2AT4A6NND4 320 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 AQP7O14520 342 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CDC14BO60729 498 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAD51DO75771 328 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LCATP04180 440 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CELA3AP09093 270 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAB4AP20338 218 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SRD5A2P31213 254 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM50BP56557 158 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAC3P60763 192 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ECH1Q13011 328 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 KCNMB1Q16558 191 aa6.09□□□□□ -1.43
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