RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486144.1

SERF2-216, Transcript of small EDRK-rich factor 2, human

TSL 2

Gene SERF2, Length 1,030 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF2-216	ENST00000486144	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144		A0A1B0GW55	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	LGALS8	O00214	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	AKR7A2	O43488	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ZFPL1	O95159	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	FSTL3	O95633	263 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TFF1	P04155	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ZNF12	P17014	697 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CFP	P27918	469 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TGFBR1	P36897	503 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RANBP1	P43487	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PSMD7	P51665	324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	GMFB	P60983	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PPP3R1	P63098	170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	GNG3	P63215	75 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	MRI1	Q9BV20	369 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DUX4	Q9UBX2	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	SYNGR1	O43759	233 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	AVP	P01185	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	GYPA	P02724	150 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	UCHL1	P09936	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	AMY2B	P19961	511 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CFHR2	P36980	270 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CALHM1	Q8IU99	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	FGFRL1	Q8N441	504 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	GPR148	Q8TDV2	347 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	AQP3	Q92482	292 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	FGGY	Q96C11	551 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144		A8MXK9	166 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RGS5	O15539	181 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ACTG1	P63261	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	PAX2	Q02962	417 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	MXD1	Q05195	221 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144		Q499Y3	187 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	MIOX	Q9UGB7	285 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	HHLA2	Q9UM44	414 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SERF2-216	ENST00000486144	NOTO	A8MTQ0	251 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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