RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 IDH3BO43837 385 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PEX14O75381 377 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LALBAP00709 142 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SELLP14151 372 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SPI1P17947 270 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SDHAP31040 664 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PYCR1P32322 319 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V1E1P36543 226 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 THBS3P49746 956 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RAB13P51153 203 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A1P53007 311 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TMED1Q13445 227 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LSAMPQ13449 338 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OTPQ5XKR4 325 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM219Q86XT9 240 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NDNFQ8TB73 568 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TSSK2Q96PF2 358 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PRR25Q96S07 402 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TBX5Q99593 518 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 JAM3Q9BX67 310 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR51E2Q9H255 320 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SORL1Q92673 2214 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 F2RL2O00254 374 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CCRL2O00421 344 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFB3O43676 98 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 AIREO43918 545 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SELENOFO60613 162 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GPX5O75715 221 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CA6P23280 308 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 HCCSP53701 268 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 WNT4P56705 351 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 VBP1P61758 197 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 HIST1H3AP68431 136 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF85Q03923 595 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 IKZF1Q13422 519 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR8G1Q15617 311 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PCK2Q16822 640 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SSX6Q7RTT6 188 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SEH1LQ96EE3 360 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CENPOQ9BU64 300 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ALG8Q9BVK2 526 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SYT4Q9H2B2 425 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 DAPL1A0PJW8 107 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TVP23AA6NH52 213 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC22A1O15245 554 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RER1O15258 196 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GMDSO60547 372 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GLCEO94923 617 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RENP00797 406 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PSKH1P11801 424 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CPEP16870 476 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms