RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 BIDP55957 195 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 H2BFSP57053 126 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FOXF2Q12947 444 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RIN1Q13671 783 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR5T1Q8NG75 326 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 UCN2Q96RP3 112 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GP6Q9HCN6 339 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MGAQ8IWI9 3026 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 H7C1Q1 480 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SULT1C2O00338 296 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 DCTN6O00399 190 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 IFI6P09912 130 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GABRR1P24046 479 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SDHAP31040 664 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CLDN18P56856 261 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PLA2G7Q13093 441 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 F8P00451 2351 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 DOCK7Q96N67 2140 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 A6NIZ1 184 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CTAG2O75638 210 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SPP1P10451 314 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF44P15621 663 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SERPINA2P20848 420 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MPGP29372 298 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 BTCP35070 178 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RAP1BP61224 184 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RAP1AP62834 184 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PPP1R1AQ13522 171 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 HNF4GQ14541 408 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SHEQ5VZ18 495 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ISOC2Q96AB3 205 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PGAM5Q96HS1 289 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 EMC6Q9BV81 110 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LRP4O75096 1905 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM218A2RU14 115 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 F5H5K5 113 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MT-ATP6P00846 226 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV1D-16P01601 117 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CRYBA1P05813 215 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM225BP0DP42 221 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ACSM1Q08AH1 577 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MALLQ13021 153 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SCGB2A2Q13296 93 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZRG5 221 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RHOFQ9HBH0 211 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MOKQ9UQ07 419 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 HMSDA8MTL9 139 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 BET1O15155 118 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PRF1P14222 555 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ALOX5APP20292 161 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GGTLC2Q14390 218 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GNMTQ14749 295 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms