RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 PDCD6O75340 191 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SNAPINO95295 136 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SYNGR4O95473 234 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 APOC3P02656 99 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF728P0DKX0 622 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CCL4P13236 92 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FUT3P21217 361 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 GLRA1P23415 457 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CHATP28329 748 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 HTR5AP47898 357 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FOXL2P58012 376 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FOXC1Q12948 553 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 BTN1A1Q13410 526 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF273Q14593 569 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 IL13RA2Q14627 380 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 GGNQ86UU5 652 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 MKXQ8IYA7 352 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 LGI3Q8N145 548 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ESX1Q8N693 406 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SMIM8Q96KF7 97 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 UCN2Q96RP3 112 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SPIN2AQ99865 258 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SEC11CQ9BY50 192 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 GP6Q9HCN6 339 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 GPR160Q9UJ42 338 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 LRP5LA4QPB2 252 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 K7EPK0 472 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 CXCL13O43927 109 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 ATG12O94817 140 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 DIRAS3O95661 229 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 SEC11BP0C7V7 166 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 ZNF32P17041 273 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 IL32P24001 234 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 CD82P27701 267 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 DUSP1P28562 367 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 S100GP29377 79 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 GFRA1P56159 465 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 PSG4Q00888 419 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 FOXO1Q12778 655 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 MPV17LQ2QL34 196 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 OR10D3Q8NH80 312 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 RELTQ969Z4 430 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 SOX7Q9BT81 388 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 NAA60Q9H7X0 242 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 PARP11Q9NR21 331 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 GPR173Q9NS66 373 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 PTPRBP23467 1997 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PP11 408 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 E9PLN8 166 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 H0YIZ8 118 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-208ENST00000464611 H7C1Q1 480 aa7.38□□□□□ -1.23
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