RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-210ENST00000449058 FRYLO94915 3013 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 DEDDO75618 318 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 IFNA21P01568 189 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ZNF728P0DKX0 622 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 PIGPP57054 158 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ABHD3Q8WU67 409 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOM1-210ENST00000449058 GALNT14Q96FL9 552 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 TECTBQ96PL2 329 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOM1-210ENST00000449058 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOM1-210ENST00000449058 TMEM187Q14656 261 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-210ENST00000449058 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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TOM1-210ENST00000449058 PDCD6O75340 191 aa14.65□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 CST4P01036 141 aa14.65□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 GUCA2BQ16661 112 aa14.65□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.65□□□□□ -0.07
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TOM1-210ENST00000449058 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 BRICD5Q6PL45 260 aa14.65□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 TOMM40LQ969M1 308 aa14.65□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 PRRX2Q99811 253 aa14.65□□□□□ -0.07
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TOM1-210ENST00000449058 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.64□□□□□ -0.07
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TOM1-210ENST00000449058 SLC22A25Q6T423 547 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 LRTM2Q8N967 370 aa14.64□□□□□ -0.07
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TOM1-210ENST00000449058 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 PIGCQ92535 297 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 ZNF205O95201 554 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 PMELP40967 661 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 SMCO1Q147U7 214 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 Q6ZPA2 131 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 FAM221AA4D161 298 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 LINC01387J3KSC0 135 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 OR5AC1P0C628 307 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 FCGR2CP31995 323 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 CALHM1Q8IU99 346 aa14.63□□□□□ -0.07
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TOM1-210ENST00000449058 POM121Q96HA1 1249 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 ZPBPQ9BS86 351 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 SPRY4Q9C004 299 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 FBXL17Q9UF56 701 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 F10P00742 488 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 LPAR6P43657 344 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 SULT1A2P50226 295 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 UCP3P55916 312 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-210ENST00000449058 MALLQ13021 153 aa14.62□□□□□ -0.07
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