RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 TRAPPC2LH3BP13 241 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF788Q6ZQV5 615 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 FAM216BQ8N7L0 139 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DNTTIP1Q9H147 329 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SMURF1Q9HCE7 757 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 RFPL4AA6NLU0 287 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 A8MXK9 166 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 KDM4BO94953 1096 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SRMP19623 302 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 HSD17B12Q53GQ0 312 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 Q8IYB0 196 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 PHYHIPQ92561 330 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 TCF7L1Q9HCS4 588 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 CLN8Q9UBY8 286 aa25.04■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 FOXH1O75593 365 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SFTPBP07988 381 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ADRA2CP18825 462 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 OR3A4PP47883 348 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 GNB2P62879 340 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 FAM166AQ6J272 317 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 LYPD6Q86Y78 171 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 GAFA1Q96PS6 74 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 VCX3AQ9NNX9 186 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 YAE1D1Q9NRH1 226 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 PTGFRP43088 359 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 GABRA2P47869 451 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 LRRTM1Q86UE6 522 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 CD177Q8N6Q3 437 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 PXT1Q8NFP0 134 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM186Q96B77 213 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 HIF1ANQ9NWT6 349 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 IL36RNQ9UBH0 155 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 WNK2Q9Y3S1 2297 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DVL1O14640 695 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 KNG1P01042 644 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 CALCBP10092 127 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 SELLP14151 372 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 ASCL4Q6XD76 172 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 FAM58AQ8N1B3 248 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 FAM192AQ9GZU8 254 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 HIVEP2P31629 2446 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 SONP18583 2426 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV20A0A0B4J274 112 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 PRDX2P32119 198 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 NPY4RP50391 375 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 GLCCI1Q86VQ1 547 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 CDH26Q8IXH8 852 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 FGFRL1Q8N441 504 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 JAGN1Q8N5M9 183 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 SDSLQ96GA7 329 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 HMG20AQ9NP66 347 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 OR14J1Q9UGF5 321 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 MAB21L2Q9Y586 359 aa25.01■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 MEGF11A6BM72 1044 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 NKX6-3A6NJ46 265 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 A8MV72 311 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 SIGLEC5O15389 551 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 ARL6IP5O75915 188 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 IL13RA1P78552 427 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 IKZF1Q13422 519 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 DGUOKQ16854 277 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 NKAIN3Q8N8D7 197 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 MED30Q96HR3 178 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 CNTD2Q9H8S5 307 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 MMP26Q9NRE1 261 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 METRNQ9UJH8 293 aa25■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 CDRT1O95170 752 aa24.99■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 TFAP2AP05549 437 aa24.99■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 PRKACAP17612 351 aa24.99■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 CALRP27797 417 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 RHOFQ9HBH0 211 aa24.99■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 KCNS2Q9ULS6 477 aa24.99■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 GALP22466 123 aa24.98■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 PAX2Q02962 417 aa24.98■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 ZNRF1Q8ND25 227 aa24.98■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 SCOCQ9UIL1 159 aa24.98■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFB3O43676 98 aa24.97■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF146Q15072 292 aa24.97■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 SLITRK2Q9H156 845 aa24.97■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 ING4Q9UNL4 249 aa24.97■■□□□ 1.59
PKDCC-202ENST00000401498 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms