RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ACSM1Q08AH1 577 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC9A3R2Q15599 337 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SPIN3Q5JUX0 258 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 C16orf87Q6PH81 154 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6YL49 198 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A26Q70HW3 274 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 VMO1Q7Z5L0 202 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM58AQ8N1B3 248 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP16Q8N5Y8 322 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 CD177Q8N6Q3 437 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNRF1Q8ND25 227 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 LHX4Q969G2 390 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM80Q96HE8 168 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX22Q96L94 193 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 OPALINQ96PE5 141 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ESM1Q9NQ30 184 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 BABAM2Q9NXR7 383 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DHDHQ9UQ10 334 aa7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DNHD1Q96M86 4753 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GW55 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 FUOMA2VDF0 154 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 POM121CA8CG34 1229 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SH2D1BO14796 132 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 MAGEB3O15480 346 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFPL1O95159 310 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 RBP4P02753 201 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 TK1P04183 234 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 CRYBA1P05813 215 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 FBP1P09467 338 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R43P59537 309 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC34A1Q06495 639 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF146Q15072 292 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 MIDNQ504T8 468 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 C3orf56Q8N813 242 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52N1Q8NH53 320 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR148Q8TDV2 347 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 THRSPQ92748 146 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF488Q96MN9 340 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 VCX3BQ9H321 246 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX4Q9UBX2 424 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.99□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 CUBNO60494 3623 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 hADV38S2A0JD32 116 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 BTBD17A6NE02 478 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BSH0 61 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 NPFFO15130 113 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 OGG1O15527 345 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SULT1B1O43704 296 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF737O75373 536 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 PAHP00439 452 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SELLP14151 372 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB3AP20336 220 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 POU3F4P49335 361 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ETV1P50549 477 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 COL10A1Q03692 680 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ST3GAL4Q11206 333 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 CDK5R1Q15078 307 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 AANATQ16613 207 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8H2Q8N162 312 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 FGFRL1Q8N441 504 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N7P7 452 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 DTX3Q8N9I9 347 aa6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MT-TS1-201ENST00000387416 CHST4Q8NCG5 386 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms