RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SYNGR3O43761 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SNAPINO95295 136 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CST4P01036 141 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CHATP28329 748 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RGS19P49795 217 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SULT1A2P50226 295 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF92Q03936 586 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SMCO1Q147U7 214 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FAM189A2Q15884 450 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NAA60Q9H7X0 242 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZFP57Q9NU63 452 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 COL6A3P12111 3177 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PI4KAP42356 2102 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FAM157AC9JC47 383 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NXPH3O95157 252 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ONECUT2O95948 504 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IFNA21P01568 189 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FGF5P12034 268 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RFC3P40938 356 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NPBWR2P48146 333 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PSG4Q00888 419 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF616Q08AN1 781 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM187Q14656 261 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RAB35Q15286 201 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MIDNQ504T8 468 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 GGNQ86UU5 652 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 KIRREL1Q96J84 757 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF175Q9Y473 711 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PINLYPA6NC86 204 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HSPB6O14558 160 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TAAR5O14804 337 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 TRAPPC6AO75865 159 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 VAMP5O95183 116 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NRASP01111 189 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CD5P06127 495 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NR2C1P13056 603 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CCL2P13500 99 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DAOP14920 347 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AADACP22760 399 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-202ENST00000342084 RBP2P50120 134 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RAB13P51153 203 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MLF1P58340 268 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RAC1P63000 192 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NHLH2Q02577 135 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 Q0VFX4 171 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IGSF11Q5DX21 431 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZSR3 168 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CALHM1Q8IU99 346 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 OSR2Q8N2R0 312 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.3□□□□□ -1.4
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