RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CSTL1Q9H114 145 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 RRASP10301 218 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 BMP4P12644 408 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ABOP16442 354 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SDC2P34741 201 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MXD1Q05195 221 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 RAB35Q15286 201 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ATP6V1FQ16864 119 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 THAP6Q8TBB0 222 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ATF6BQ99941 703 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 NIPAL2Q9H841 368 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 APC2O95996 2303 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ATMQ13315 3056 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CRYBA1P05813 215 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CX3CR1P49238 355 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MTNR1BP49286 362 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 GZMKP49863 264 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MMP16P51512 607 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PCBD1P61457 104 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 KLRB1Q12918 225 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FGFBP3Q8TAT2 258 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 RAB3CQ96E17 227 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ASF1BQ9NVP2 202 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 A0A096LPE4 126 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPZ6 126 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SHISA3A0PJX4 238 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 A6NNC1 897 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CASKO14936 926 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SYNGR3O43761 229 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ITGA5P08648 1049 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 UCHL1P09936 223 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PATE4P0C8F1 98 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ZNF32P17041 273 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MYL9P24844 172 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MPGP29372 298 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 RAB5CP51148 216 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 RORCP51449 518 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FOXF2Q12947 444 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MAB21L1Q13394 359 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 Q499Y3 187 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CDNFQ49AH0 187 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ZNF774Q6NX45 483 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 GFRALQ6UXV0 394 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 RDH10Q8IZV5 341 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 COQ8AQ8NI60 647 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SLC7A6Q92536 515 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.26□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC13O75165 2243 aa5.26□□□□□ -1.57
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