RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 DNPH1O43598 174 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 PMP2P02689 132 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 GNLYP22749 145 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 RAB9AP51151 201 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ZNF154Q13106 437 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ZNF429Q86V71 674 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 CA10Q9NS85 328 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 SPINT1O43278 529 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 TMEM11P17152 192 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ID1P41134 155 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 Q56UQ5 140 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 RNLSQ5VYX0 342 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 OR4C3Q8NH37 302 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 MAVSQ7Z434 540 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 TMEM129A0AVI4 362 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 CLDN1O95832 211 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 B4GALT1P15291 398 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 FAM106CPP0CH98 169 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 ZNF787Q6DD87 383 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ABHD6Q9BV23 337 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.95□□□□□ -1.3
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