RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 PDXPQ96GD0 296 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF488Q96MN9 340 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM243Q9BU79 118 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM100Q9NV29 134 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PSG11Q9UQ72 335 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 LAMC1P11047 1609 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 RAD50Q92878 1312 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 CHD1O14646 1710 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 UNC13BO14795 1591 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0A6YYH2 397 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ISPDA4D126 451 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 A6NJ64 397 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF233A6NK53 670 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TCAPO15273 167 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 KLHL2O95198 593 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 DTYMKP23919 212 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PAX6P26367 422 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 GTF2H1P32780 548 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 APLNRP35414 380 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ERFP50548 548 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB38P57729 211 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 KRTAP12-2P59991 146 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 NAB1Q13506 487 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TTC32Q5I0X7 151 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 IDNKQ5T6J7 187 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 HHATQ5VTY9 493 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 GAPTQ8N292 157 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TMED9Q9BVK6 235 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 DRC3Q9H069 523 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 DSN1Q9H410 356 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 HMG20AQ9NP66 347 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ABCB9Q9NP78 766 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP10BO94823 1461 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA0232Q92628 1395 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PLCH2O75038 1416 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 GOLGA6L10A6NI86 522 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 MED6O75586 246 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC22A5O76082 557 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 MYO1DO94832 1006 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 SNAP29O95721 258 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PET100P0DJ07 73 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 AQP5P55064 265 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 GFERP55789 205 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 CRADDP78560 199 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 CYP24A1Q07973 514 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB31Q13636 194 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 C6orf99Q4VX62 202 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ACBD4Q8NC06 268 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 CDS1Q92903 461 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 PTX4Q96A99 478 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 FOPNLQ96NB1 174 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 HBEGFQ99075 208 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 C12orf10Q9HB07 376 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCA2-241ENST00000635397 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms