RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	HSBP1	O75506	76 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	OXT	P01178	125 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PRB1	P04280	392 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	GZMH	P20718	246 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CFHR2	P36980	270 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CLDN18	P56856	261 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ITIH4	Q14624	930 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00303	Q3SY05	128 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PCOTH	Q58A44	107 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TUBA4B	Q9H853	241 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM100	Q9NV29	134 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PRO0628	Q9UI54	55 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	VAX2	Q9UIW0	290 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	NAGK	Q9UJ70	344 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO9B	Q13459	2157 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A0B4J2C4	111 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1B0GU33	70 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		H0YC42	278 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BN98	237 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFS5	O43920	106 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	OR2A4	O95047	310 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	GNRHR	P30968	328 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC18A1	P54219	525 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CLDN6	P56747	220 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	DHRS2	Q13268	280 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	IL18	Q14116	193 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CDNF	Q49AH0	187 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TTMP	Q5BVD1	217 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM25	Q86YD3	366 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF738	Q8NE65	137 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	OR8S1	Q8NH09	359 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PYURF	Q96I23	114 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CFAP53	Q96M91	514 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	OR2A7	Q96R45	310 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	OR51B5	Q9H339	312 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRC19	Q9H756	370 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	C6orf50	Q9HD87	102 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		J3QT63	122 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		K7EPK0	472 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC37A4	O43826	429 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAJB6	O75190	326 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CTAG2	O75638	210 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TRGV3	P03979	118 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	GZMA	P12544	262 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CRABP2	P29373	138 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	MAGEA1	P43355	309 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CST6	Q15828	149 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	GABRA6	Q16445	453 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TTC32	Q5I0X7	151 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227		Q8NAQ8	132 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	BBOF1	Q8ND07	529 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	AGR3	Q8TD06	166 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	SRR	Q9GZT4	340 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	EXO5	Q9H790	373 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	PXMP2	Q9NR77	195 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	CFL2	Q9Y281	166 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SNAP23-215	ENST00000568227	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		0.74	□□□□□ -2.29

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