RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 SSX6Q7RTT6 188 aa8.72□□□□□ -1.01
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PDXDC1-211ENST00000565362 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.72□□□□□ -1.01
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PDXDC1-211ENST00000565362 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.72□□□□□ -1.01
PDXDC1-211ENST00000565362 PIFOQ8TCI5 191 aa8.72□□□□□ -1.01
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PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1W2PRV1 198 aa8.71□□□□□ -1.02
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PDXDC1-211ENST00000565362 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.7□□□□□ -1.02
PDXDC1-211ENST00000565362 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDXDC1-211ENST00000565362 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDXDC1-211ENST00000565362 CHST5Q9GZS9 411 aa8.69□□□□□ -1.02
PDXDC1-211ENST00000565362 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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PDXDC1-211ENST00000565362 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.68□□□□□ -1.02
PDXDC1-211ENST00000565362 CHST1O43916 411 aa8.68□□□□□ -1.02
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