RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf50Q9BV19 199 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 FBXL17Q9UF56 701 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 A0A087WW49 117 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PPM1 405 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CDIPTO14735 213 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RER1O15258 196 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SIGLEC5O15389 551 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 AKR7A2O43488 359 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV3-20P01619 116 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 GSTA1P08263 222 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 GSTA2P09210 222 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CD7P09564 240 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR8U9P0C7N5 309 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 COX5BP10606 129 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 PRPS1L1P21108 318 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SERPINB5P36952 375 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 DLX6P56179 175 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 HNF4GQ14541 408 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 FAM91A1Q658Y4 838 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00471Q8N535 108 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR2T27Q8NH04 317 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SEPHS2Q99611 448 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 USE1Q9NZ43 259 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 HHLA2Q9UM44 414 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PPI3 338 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 FAM172BPA6NC97 362 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR6C6A6NF89 314 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 GAGE10A6NGK3 116 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 OR2AT4A6NND4 320 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CD300LBA8K4G0 201 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 C17orf98A8MV24 154 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 H7C1C5 153 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 GMDSO60547 372 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 IGHG2P01859 326 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 BCHEP06276 602 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CTLA4P16410 223 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 MSR1P21757 451 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 BRS3P32247 399 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ASIPP42127 132 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 PAFAH1B1P43034 410 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SERPINB8P50452 374 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RPS6KA3P51812 740 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 UGT2B15P54855 530 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CDH12P55289 794 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CD81P60033 236 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ISL1P61371 349 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 LCN6P62502 163 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ACTA2P62736 377 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ACTG2P63267 376 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ACTC1P68032 377 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ACTA1P68133 377 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 PITPNAQ00169 270 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP161Q6P656 301 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 PGAP1Q75T13 922 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-210ENST00000561408 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms