RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RFT1Q96AA3 541 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 YIPF6Q96EC8 236 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 KCTD7Q96MP8 289 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RNF223E7ERA6 249 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 KDM4BO94953 1096 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 GADD45AP24522 165 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PTGFRP43088 359 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ACP7Q6ZNF0 438 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SLAMF9Q96A28 289 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM165Q9HC07 324 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 IL36GQ9NZH8 169 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 NLKQ9UBE8 527 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 GHRLQ9UBU3 117 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MIOXQ9UGB7 285 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 C3orf80F5H4A9 247 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TFAP2AP05549 437 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ALDH3B2P48448 385 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MTNR1BP49286 362 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 GPR176Q14439 515 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 GPR141Q7Z602 305 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TPRA1Q86W33 373 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR51E2Q9H255 320 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 AIREO43918 545 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 KNG1P01042 644 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 UBBP0CG47 229 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CD37P11049 281 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ADRA2CP18825 462 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FAM201AQ5SY85 155 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 STUMQ69YW2 141 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ASCL4Q6XD76 172 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 LYPD6Q86Y78 171 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 KAAG1Q9UBP8 84 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR2AT4A6NND4 320 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 H7C1Q1 480 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV2-5P01817 119 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR3A4PP47883 348 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CAPZA1P52907 286 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RSU1Q15404 277 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ELP2Q6IA86 826 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 METTL9Q9H1A3 318 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MAST4O15021 2626 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 WNT9BO14905 357 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ANGPTL7O43827 346 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF205O95201 554 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FOSL1P15407 271 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RAB3BP20337 219 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 AWAT2Q6E213 333 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR8B2Q96RD0 313 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 GLS2Q9UI32 602 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 V9GY05 133 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.093e-9■■□□□ 13.9
PTPRK-218ENST00000525459 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-218ENST00000525459 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-218ENST00000525459 BCL3P20749 454 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-218ENST00000525459 CFPP27918 469 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-218ENST00000525459 NPY4RP50391 375 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms