RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	TCF23	Q7RTU1	214 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	IFT20	Q8IY31	132 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	DCUN1D4	Q92564	292 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	SGK3	Q96BR1	496 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	COPS4	Q9BT78	406 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	GON7	Q9BXV9	100 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	ABCB9	Q9NP78	766 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	RASL12	Q9NYN1	266 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR6C68	A6NDL8	312 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	CXorf65	A6NEN9	183 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	NUPR2	A6NF83	97 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	LEUTX	A8MZ59	168 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	AP4M1	O00189	453 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FGF16	O43320	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	NDUFB2	O95178	105 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	TXNDC12	O95881	172 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ARSB	P15848	533 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPM6A	P51674	278 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	EDDM3B	P56851	147 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	STX3	Q13277	289 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	SNCB	Q16143	134 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRRC1	Q96M27	445 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR8B4	Q96RC9	309 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	KCNJ15	Q99712	375 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR51I2	Q9H344	312 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	GHITM	Q9H3K2	345 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	BAG5	Q9UL15	447 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	C12orf77	C9JDV5	145 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384		I3L521	148 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384		K7N7A8	449 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	HSPA12A	O43301	675 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	BRI3	O95415	125 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	CST4	P01036	141 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	KIT	P10721	976 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	CEACAM3	P40198	252 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	MNDA	P41218	407 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPS6KA3	P51812	740 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	MTPN	P58546	118 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	TAF13	Q15543	124 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00471	Q8N535	108 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	LZIC	Q8WZA0	190 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	AQP3	Q92482	292 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	SPDL1	Q96EA4	605 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR52B2	Q96RD2	323 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	NMNAT3	Q96T66	252 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	RHCG	Q9UBD6	479 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	PKHD1	P08F94	4074 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	PSMD9	O00233	223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	MMP23A	O75900	390 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	REN	P00797	406 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGLV1-47	P01700	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGHG4	P01861	327 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTP4A2-208	ENST00000524384	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41

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