RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF122Q9H9V4 155 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM206AQ9NX38 181 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC2A8Q9NY64 477 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 DUX4Q9UBX2 424 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 X6R8D5 127 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGF2RP11717 2491 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.85□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0D9SG52 128 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1B0GTI1 187 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM235A6NFC5 223 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF716A6NP11 495 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF878C9JN71 531 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHHO43323 396 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAMP1O60894 148 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD8AP01732 235 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHRM2P08172 466 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 NMBP08949 121 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBBP0CG47 229 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 PGA4P0DJD7 388 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 PGA3P0DJD8 388 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF250P15622 560 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBPP20226 339 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB3AP20336 220 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD34P28906 385 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNALP38405 381 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 P2RY4P51582 365 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SORDQ00796 357 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGFBR3Q03167 851 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF13Q15543 124 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDNFQ49AH0 187 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM65Q6PI78 240 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CORO6Q6QEF8 472 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC51BQ86UW2 128 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHST4Q8NCG5 386 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR4D6Q8NGJ1 314 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABHD3Q8WU67 409 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM45BQ96B21 275 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 APH1AQ96BI3 265 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC6A7Q99884 636 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHST6Q9GZX3 395 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MFFQ9GZY8 342 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARL6Q9H0F7 186 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 BCO1Q9HAY6 547 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 IFT46Q9NQC8 304 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 COMMD9Q9P000 198 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 MGAQ8IWI9 3026 aa4.84□□□□□ -1.63
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.84□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 SVILO95425 2214 aa4.83□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.83□□□□□ -1.64
ARHGEF3-215ENST00000498517 WIPF3A6NGB9 483 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms