RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.62□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.62□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 CLEC2DQ9UHP7 191 aa13.62□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 DNHD1Q96M86 4753 aa13.62□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 XPNPEP2O43895 674 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 FPR2P25090 351 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ATP1B3P54709 279 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 RIPK1Q13546 671 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 CDK5R1Q15078 307 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SMIM21Q3B7S5 101 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 RNLSQ5VYX0 342 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 FGFRL1Q8N441 504 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 OR13C3Q8NGS6 347 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ST8SIA4Q92187 359 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SPSB1Q96BD6 273 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 OCEL1Q9H607 264 aa13.61□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 RFPL4AA6NLU0 287 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 LALBAP00709 142 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF20P17024 532 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 MYL12AP19105 171 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 PRDX2P32119 198 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 AQP4P55087 323 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 BPIFB3P59826 476 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 FGF12P61328 243 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 MED21Q13503 144 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ARMCX4Q5H9R4 360 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF529Q6P280 563 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 CD177Q8N6Q3 437 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 WDFY2Q96P53 400 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SIRPDQ9H106 197 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF69Q9UC07 566 aa13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 F8VVB4 439 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 F8VWA3 439 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 NXPH2O95156 264 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 VENTXO95231 258 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 KNG1P01042 644 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 TFF1P04155 84 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 SELLP14151 372 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 GABRA2P47869 451 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 MTCP1P56278 107 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 HILS1P60008 231 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 IKZF1Q13422 519 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 MKXQ8IYA7 352 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF561Q8N587 486 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 ZFAND2BQ8WV99 257 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 GATAD2BQ8WXI9 593 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 CEP19Q96LK0 163 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 OPALINQ96PE5 141 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 TBX15Q96SF7 602 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 KPTNQ9Y664 436 aa13.59□□□□□ -0.23
ATG4B-216ENST00000475195 TOX4O94842 621 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 CD1AP06126 327 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 ARF6P62330 175 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 ASPHD2Q6ICH7 369 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A26Q70HW3 274 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 KIR3DL3Q8N743 410 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 NANOGP1Q8N7R0 232 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 GPR148Q8TDV2 347 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 SMIM19Q96E16 107 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 RHOFQ9HBH0 211 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 DHDHQ9UQ10 334 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF281Q9Y2X9 895 aa13.58□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.57□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 RNF212BA8MTL3 300 aa13.57□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 SULT1B1O43704 296 aa13.57□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 SFTPBP07988 381 aa13.57□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 MYF6P23409 242 aa13.57□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 PDCD1Q15116 288 aa13.57□□□□□ -0.24
ATG4B-216ENST00000475195 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms