RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 DNPH1O43598 174 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CER1O95813 267 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 SCGB1D2O95969 90 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 FAM157CP0CG43 387 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CTRB1P17538 263 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 HOXA6P31267 233 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 FXYD4P59646 89 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 PDCD1Q15116 288 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CCDC157Q569K6 752 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 FOXB1Q99853 325 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 PRO3102Q9H379 93 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 LIME1Q9H400 295 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 TREM1Q9NP99 234 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 IGHV3-9P01782 118 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 PIGPP57054 158 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 BLOC1S1P78537 153 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 OR2A2Q6IF42 318 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 OR6C6A6NF89 314 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 IFNA21P01568 189 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 HKR1P10072 659 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZNF708P17019 499 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZNF92Q03936 586 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 STK11Q15831 433 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 BATF2Q8N1L9 274 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 PIGCQ92535 297 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 TCFL5Q9UL49 500 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 LRP3O75074 770 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TSPAN9O75954 239 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 IGKV1D-12P01611 117 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FCGR3AP08637 254 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 GDF1P27539 372 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SMCO1Q147U7 214 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-207ENST00000462494 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SVBPQ8N300 66 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ABHD3Q8WU67 409 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 MMP26Q9NRE1 261 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 DEPPQ9NTK1 212 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 HSF4Q9ULV5 492 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF728P0DKX0 622 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CHATP28329 748 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ACER2Q5QJU3 275 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SKA3Q8IX90 412 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OSR2Q8N2R0 312 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 FBXO24O75426 580 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 GLI4P10075 376 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ICAM2P13598 275 aa14.69□□□□□ -0.06
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