RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DISC1C4P0D8 188 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SSNA1O43805 119 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ANGPTL7O43827 346 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 LILRA1O75019 489 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RGS11O94810 467 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MPC2O95563 127 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PDGFAP04085 211 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SFTPBP07988 381 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PPP3CBP16298 524 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-2P23083 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DTYMKP23919 212 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RBP2P50120 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CCL11P51671 97 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MTCP1P56278 107 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RAB1AP62820 205 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CXADRP78310 365 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS2Q13268 280 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ARL6IP1Q15041 203 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GABRA6Q16445 453 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZS49 121 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZT83 130 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CHST4Q8NCG5 386 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR51T1Q8NGJ9 327 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR8S1Q8NH09 359 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 TERB2Q8NHR7 220 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 NPRL2Q8WTW4 380 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MITD1Q8WV92 249 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GPER1Q99527 375 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 METTL9Q9H1A3 318 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 LIME1Q9H400 295 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GPR160Q9UJ42 338 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ING4Q9UNL4 249 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GPR132Q9UNW8 380 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 AUP1Q9Y679 476 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ATMQ13315 3056 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0B4J2A0 478 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf170A2RU37 121 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf49A4QMS7 147 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CD300LBA8K4G0 201 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MCRIP1C9JLW8 97 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS44E7EML9 344 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 F8VVB4 439 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 F8VWA3 439 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 TNFSF13O75888 250 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV1-44P01699 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FCER2P06734 321 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL2P19875 107 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA2P20848 420 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DNASE1P24855 282 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ATP1B3P54709 279 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PER3P56645 1201 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R46P59540 309 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GNG2P59768 71 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PRDX4Q13162 271 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 IL15RAQ13261 267 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R1AQ13522 171 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA5Q16718 116 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.84□□□□□ -1.63
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