RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CALHM1	Q8IU99	346 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM106A	Q96A25	262 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SIGLEC5	O15389	551 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEB3	O15480	346 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SYNGR1	O43759	233 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GPX5	O75715	221 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NXPH2	O95156	264 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ALDOB	P05062	364 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SRD5A1	P18405	259 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RAB3A	P20336	220 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CAV3	P56539	151 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GABARAPL2	P60520	117 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IL13RA1	P78552	427 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SDSL	Q96GA7	329 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	POM121	Q96HA1	1249 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CEP19	Q96LK0	163 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MRI1	Q9BV20	369 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		12.17	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	DVL1	O14640	695 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFB3	O43676	98 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	KNG1	P01042	644 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA2	P01563	188 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PSG2	P11465	335 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CEL	P19835	753 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FST	P19883	344 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PPP3R1	P63098	170 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PAX8	Q06710	450 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF561	Q8N587	486 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CKLF	Q9UBR5	152 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF222	Q9UK12	451 aa		12.16	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	BMX	P51813	675 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GAFA1	Q96PS6	74 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CCL13	Q99616	98 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.15	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF879	B4DU55	563 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	HCK	P08631	526 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	AMY2B	P19961	511 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SOX2	P48431	317 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	MED22	Q15528	200 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	TRAM1	Q15629	374 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	KISS1	Q15726	138 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	CDH26	Q8IXH8	852 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	PXT1	Q8NFP0	134 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	NANP	Q8TBE9	248 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SEH1L	Q96EE3	360 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	OR5M11	Q96RB7	305 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	MMP26	Q9NRE1	261 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	OPN4	Q9UHM6	478 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		12.14	□□□□□ -0.47

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