RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 LIME1Q9H400 295 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 GHRLQ9UBU3 117 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF728P0DKX0 622 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 GALNSP34059 522 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A45Q8N413 288 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 AQP10Q96PS8 301 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 AK3Q9UIJ7 227 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 COLCA2A8K830 154 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 B4GALT1P15291 398 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TBPP20226 339 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 PTAFRP25105 342 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MYOTQ9UBF9 498 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CST4P01036 141 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHMP01871 453 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 EPHA1P21709 976 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM100Q9NV29 134 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FABP1P07148 127 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 UBALD1Q8TB05 177 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC22A8Q8TCC7 542 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TNFSF11O14788 317 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FOSL2P15408 326 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CFPP27918 469 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ACTBL2Q562R1 376 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF774Q6NX45 483 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 GUSBP11Q6P575 273 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM156Q8N614 296 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 MVB12AQ96EY5 273 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAPPC6AO75865 159 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL2P13500 99 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 BORCS8Q96FH0 119 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF576Q9H609 170 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CD37P11049 281 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ACKR3P25106 362 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 NAAAQ02083 359 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF529Q6P280 563 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF441Q8N8Z8 693 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PI4KAP42356 2102 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFAND5O76080 213 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 JTBO76095 146 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 YIF1AO95070 293 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PPA1Q15181 289 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PRR18Q8N4B5 295 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SHDQ96IW2 340 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 WFDC1Q9HC57 220 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MSR1P21757 451 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ECH1Q13011 328 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 D2HGDHQ8N465 521 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TCEAL3Q969E4 200 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RASL10BQ96S79 203 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SSSCA1O60232 199 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SULT1A2P50226 295 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 HERV-K104P61576 105 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MIOXQ9UGB7 285 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 DKKL1Q9UK85 242 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PR77 199 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RUNX1Q01196 453 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZP4Q12836 540 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 C4orf17Q53FE4 359 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GJC3Q8NFK1 279 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM8Q96KF7 97 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 OXGR1Q96P68 337 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 FCGR3AP08637 254 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 GSK3AP49840 483 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM209BQ5JX69 171 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms