RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-204ENST00000403441 OR52A1Q9UKL2 312 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-204ENST00000403441 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-204ENST00000403441 ZNF850A8MQ14 1090 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 WBP4O75554 376 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ALX3O95076 343 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 BAG2O95816 211 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SELLP14151 372 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 NDUFB7P17568 137 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 PEX2P28328 305 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 DLX1P56177 255 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ZNF91Q05481 1191 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 RCN1Q15293 331 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 LPCAT4Q643R3 524 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR14K1Q8NGZ2 314 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 LGALS12Q96DT0 336 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 TBX5Q99593 518 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 JAM3Q9BX67 310 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 AASSQ9UDR5 926 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SNTNA6NMZ2 147 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 H0YAE9 185 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 EFNB2P52799 333 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 CAV3P56539 151 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 FAM189A2Q15884 450 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ZNF691Q5VV52 312 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ACBD7Q8N6N7 88 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 DTX3Q8N9I9 347 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 TNFRSF14Q92956 283 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 Q96MT0 163 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 GAFA1Q96PS6 74 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SSX3Q99909 188 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 WDR13Q9H1Z4 485 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SLC22A13Q9Y226 551 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR5B21A6NL26 309 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SIGLEC5O15389 551 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ANGPTL7O43827 346 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ISG15P05161 165 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 FAHP16930 419 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 AMY2BP19961 511 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 KIR3DL2P43630 455 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 KIR2DS4P43632 304 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 CCR9P51686 369 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 RAB40BQ12829 278 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 DGUOKQ16854 277 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZPA2 131 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 SYS1Q8N2H4 156 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ANGPTL6Q8NI99 470 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 CFHR4Q92496 578 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 PIGCQ92535 297 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR51I2Q9H344 312 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 NLKQ9UBE8 527 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 OR2AT4A6NND4 320 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 AKR7A2O43488 359 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V1E1P36543 226 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 GABRA2P47869 451 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-204ENST00000403441 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms