RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 POU3F4P49335 361 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ACP7Q6ZNF0 438 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MED30Q96HR3 178 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CEP19Q96LK0 163 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF488Q96MN9 340 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ABCA2Q9BZC7 2435 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 J3QLI3 93 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CD276Q5ZPR3 534 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 Q8IYB0 196 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 OR13C5Q8NGS8 318 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 UFD1Q92890 307 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ISYNA1Q9NPH2 558 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TAS2R4Q9NYW5 299 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CTSZQ9UBR2 303 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 GABRA2P47869 451 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 PDZK1IP1Q13113 114 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF529Q6P280 563 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TEX29Q8N6K0 151 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 FN1P02751 2386 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 DVL1O14640 695 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 NDUFB3O43676 98 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 PSG2P11465 335 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ERVK11-1P61568 191 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 IL13RA1P78552 427 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 KISS1Q15726 138 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 SLAMF9Q96A28 289 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 OR14A2Q96R54 314 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM138Q9NPI0 162 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MTCH1Q9NZJ7 389 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 LOC105371242A0A075B767 164 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF879B4DU55 563 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 GPR37O15354 613 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 DOC2BQ14184 412 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC10Q5BKY1 277 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF788Q6ZQV5 615 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SVOPQ8N4V2 548 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 RFT1Q96AA3 541 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SPACA5Q96QH8 159 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 GPER1Q99527 375 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 HES4Q9HCC6 221 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 MMP26Q9NRE1 261 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 MAP2K4P45985 399 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 RFPL4AA6NLU0 287 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 INMTO95050 263 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 KNG1P01042 644 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ALDOBP05062 364 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 BDKRB2P30411 391 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 RIPPLY3P57055 190 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 IKZF1Q13422 519 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 LIPKQ5VXJ0 399 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SATL1Q86VE3 508 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SAXO1Q8IYX7 474 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 BATF2Q8N1L9 274 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 FAM216BQ8N7L0 139 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 OR51A2Q8NGJ7 313 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 OR5D18Q8NGL1 313 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ST8SIA4Q92187 359 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 MGLLQ99685 303 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 TMED9Q9BVK6 235 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SMURF1Q9HCE7 757 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC42Q9Y546 428 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 INSIG2Q9Y5U4 225 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SIGLEC5O15389 551 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 GPX5O75715 221 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM225BP0DP42 221 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 AMY2BP19961 511 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 PRDX2P32119 198 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 TGFBR2P37173 567 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 TPBGQ13641 420 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ASPHD2Q6ICH7 369 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 DERL3Q96Q80 235 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 MRI1Q9BV20 369 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 RHOFQ9HBH0 211 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-204ENST00000400919 ENSAO43768 121 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms