RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 BTN3A3O00478 584 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ERC2-IT1O76042 136 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 C2P06681 752 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TFPTP0C1Z6 253 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TWF1Q12792 350 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR4F3Q6IEY1 312 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR6B2Q6IFH4 312 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CNSTQ6PJW8 725 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 NPWQ8N729 165 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 GPR26Q8NDV2 337 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNRF2Q8NHG8 242 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PSMA8Q8TAA3 256 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM106AQ96A25 262 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 S100PBPQ96BU1 408 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC41A3Q96GZ6 507 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 LINC01600Q96MT4 127 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR4K3Q96R72 315 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRIM4Q9C037 500 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 BTRCQ9Y297 605 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 MEMO1Q9Y316 297 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PTPRSQ13332 1948 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 WDR97A6NE52 1622 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 KIF24Q5T7B8 1368 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 NCOA1Q15788 1441 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATP10AO60312 1499 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ISPDA4D126 451 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 GRIFINA4D1Z8 144 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TP53I11O14683 189 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR1F1O43749 312 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 KLHL41O60662 606 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 LY6HO94772 140 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 NPPAP01160 153 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PTNP21246 168 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CD164Q04900 197 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PJVKQ0ZLH3 352 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 MLIPQ5VWP3 458 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR8H2Q8N162 312 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 DRAM1Q8N682 238 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR4D5Q8NGN0 318 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ANGPTL6Q8NI99 470 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 C10orf35Q96D05 121 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMARCD1Q96GM5 515 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 Q96M85 177 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TCEANC2Q96MN5 208 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 MFFQ9GZY8 342 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRTM1Q9HBL6 345 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 NUDCQ9Y266 331 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 E9PCH4 1651 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CFAP73A6NFT4 308 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 H3BMM0 161 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CLDN3O15551 220 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TGOLN2O43493 480 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 KITLGP21583 273 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CTBP2P56545 445 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ACTG2P63267 376 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 BEX3Q00994 111 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPAG11BQ08648 103 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 NADK2Q4G0N4 442 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCDC50Q8IVM0 306 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 MAIP1Q8WWC4 291 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 RORBQ92753 470 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 UBE2WQ96B02 151 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TTC25Q96NG3 672 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 KCNS3Q9BQ31 491 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 MED9Q9NWA0 146 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 BFARQ9NZS9 450 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATXN10Q9UBB4 475 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 CD300AQ9UGN4 299 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 OBSL1O75147 1896 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PTPRBP23467 1997 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 EML6Q6ZMW3 1958 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms