RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 KCTD7Q96MP8 289 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RGCCQ9H4X1 137 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 R4GMQ9 66 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.29□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 CTXN2P0C2S0 81 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 B4GALT1P15291 398 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 OR3A2P47893 321 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 ODF4Q2M2E3 257 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 R3HDM4Q96D70 268 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RNF125Q96EQ8 232 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RAB9BQ9NP90 201 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 PRSS50Q9UI38 385 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GW55 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SC5DO75845 299 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 STOMP27105 288 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 AKR1C3P42330 323 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 TAF13Q15543 124 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 NRN1LQ496H8 165 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 WDR38Q5JTN6 314 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 OR2A2Q6IF42 318 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 GJC3Q8NFK1 279 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 ERGIC1Q969X5 290 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 C4orf45Q96LM5 186 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 GGACTQ9BVM4 153 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DUX4Q9UBX2 424 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 NAGKQ9UJ70 344 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 MGAQ8IWI9 3026 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 TMEM212A6NML5 194 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 WDR1O75083 606 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 UPK1BO75841 260 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 CDRT1O95170 752 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 GABRA1P14867 456 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 DCTDP32321 178 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 PKIAP61925 76 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 TATDN3Q17R31 274 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RTL6Q6ICC9 239 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 CD163Q86VB7 1156 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 MCFD2Q8NI22 146 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 HARBI1Q96MB7 349 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 POFUT1Q9H488 388 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 FAM206AQ9NX38 181 aa5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CCR6-201ENST00000341935 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FABP12A6NFH5 140 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 M0R143 59 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 PHOX2AO14813 284 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 CTAG2O75638 210 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR5I1Q13606 314 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 GUK1Q16774 197 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TMEM177Q53S58 311 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ZNF627Q7L945 461 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 SKA3Q8IX90 412 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 TMEM104Q8NE00 496 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.27□□□□□ -1.57
CCR6-201ENST00000341935 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.27□□□□□ -1.57
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