RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 CHRDL1Q9BU40 450 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 RAB1BQ9H0U4 201 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 POMT1Q9Y6A1 747 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 CYR61O00622 381 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 IGFBP7Q16270 282 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
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PTPRM-201ENST00000332175 CD96P40200 585 aa19.88■□□□□ 0.77
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PTPRM-201ENST00000332175 K7ESF4 209 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 THSD4Q6ZMP0 1018 aa19.85■□□□□ 0.77
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
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PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 GVQW1Q8N7I0 195 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 OR5V1Q9UGF6 321 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-201ENST00000332175 NTN1O95631 604 aa19.84■□□□□ 0.77
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