RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326470.9

SSH1-201, Transcript of slingshot protein phosphatase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SSH1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH1-201ENST00000326470 FAHP16930 419 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 CHATP28329 748 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 FOXL2P58012 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 IL13RA2Q14627 380 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 RNF138Q8WVD3 245 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 Q96M66 194 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 GGACTQ9BVM4 153 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 A0A0U1RQV5 110 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 OR2C1O95371 312 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF728P0DKX0 622 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 RAB2AP61019 212 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 C18orf12Q96KH6 178 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 OXGR1Q96P68 337 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 A0A1W2PNR3 127 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF726A6NNF4 738 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 K7N7A8 449 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 WRBO00258 174 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 HOXA5P20719 270 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 MSX1P28360 303 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 DTX1Q86Y01 620 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 LRRC18Q8N456 261 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TOMM40LQ969M1 308 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 DUSP1P28562 367 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NHLH2Q02577 135 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 D2HGDHQ8N465 521 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PIGTQ969N2 578 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ST8SIA3O43173 380 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 RAMP1O60894 148 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 Q6ZSR3 168 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PIGQQ9BRB3 760 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 F5H5K5 113 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 OR1D5P58170 312 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 MUCL1Q96DR8 90 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.6□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 DTYMKP23919 212 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 RRADP55042 308 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TDHQ8IZJ6 230 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 CARFQ8N187 725 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 C10orf35Q96D05 121 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 RARRES2Q99969 163 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 AK3Q9UIJ7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 HSF4Q9ULV5 492 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.59□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 A0A1B0GV50 99 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 CFHR1Q03591 330 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 LGI3Q8N145 548 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 GJC3Q8NFK1 279 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 MR1Q95460 341 aa14.58□□□□□ -0.07
SSH1-201ENST00000326470 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SSH1-201ENST00000326470 YIF1AO95070 293 aa14.58□□□□□ -0.08
SSH1-201ENST00000326470 OPRM1P35372 400 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms